一個普通的無塵無菌車間，會涉及到凈化裝飾、地面、凈化空調與通風系統、冷熱源系統、照明系統、動力系統、通信系統、監控系統、自動化控制系統、給排水系統、工藝管道系統等工程。對設計工藝的要求比較高，而食品無塵無菌車間，比普通的無塵無菌車間會更復雜，需要考量的因素更多。那么，在使用無塵無菌車間的過程中，有哪些注意事項呢？
1、食品無菌室嚴格無菌操作，防止微生物污染；操作人員進入無菌室應先關掉紫外燈。
2、食品凈化車間應設有無菌操作間和緩沖間，無菌操作間潔凈度應達到10000級，室內溫度保持在20-24℃，濕度保持在45-60%。超凈臺潔凈度應達到100級。
3、潔凈車間無菌室應保持清潔，嚴禁堆放雜物，以防污染。嚴防一切滅菌器材和培養基污染，已污染者應停止使用。
4、潔凈車間無菌室應定期用適宜的消毒液滅菌清潔，以保證無菌室的潔凈度符合要求。
5、需要帶入潔凈車間無菌室使用的儀器、器械、平皿等一切物品，均應包扎嚴密，并應經過適宜的方法滅菌。
6、工作人員進入潔凈車間無菌室前，必須用肥皂或消毒液洗手消毒，然后在緩沖間更換專用工作服、鞋、帽子、口罩和手套（或用70%的乙醇再次擦拭雙手），方可進入潔凈車間無菌室進行操作。
7、潔凈車間無菌室使用前必須打開無菌室的紫外燈輻照滅菌30分鐘以上，并且同時打開超凈臺進行吹風。操作完畢，應及時清理無菌室，再用紫外燈輻照滅菌20分鐘。
8、供試品在檢查前，應保持外包裝完整，不得開啟，以防污染。檢查前，用70%的酒精棉球消毒外表面。
9、凡帶有活菌的物品，必須經消毒后，才能在水龍頭下沖洗，嚴禁污染下水道。
